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L’un des buts principaux de Shipstern est de contribuer à a conservation active et pratique dans le terrain. Les patrouilles dans la réserve représentent l’outil le plus important. Les patrouilles ont lieu tous les jours et dans toutes les régions de la réserve. Pour les régions éloignées les patrouilles durent 2 à 3 jours et des camps permanents permettent d’y passer la nuit.
Pendant les premiers six mois de l’année, les gardiens ont du travail supplémentaire dans le lagon de Shipstern. L’un des gardiens vie à Iguana Camp avec sa famille et fait des patrouilles autour de deux îles mangroves, lieu de reproduction d’une grande colonie de cigognes américaines. Grâce à ces efforts, les effectifs de cette espèce rare de cigognes ont pu être augmentés à une moyenne de 200 couples depuis son retour sur place en 1992.
Le gardien chef et son équipe forment la base pour la conservation concrète dans le terrain. A part les patrouilles, les gardiens de Shipstern s’occupent des infrastructures, accompagnent les écoles et accueillent et guident les visiteurs dans le terrain.
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